Genetic barcoding in a Paramacrobiotus species (Tardigrada: Parachela) in Santa Marta, Colombia

Caicedo, Martín; Arquez, Moisés; Castro, Lyda R.; Quiroga, Sigmer

Genetic barcoding in a Paramacrobiotus species (Tardigrada: Parachela) in Santa Marta, Colombia Códigos de barras genéticos en una especie de Paramacrobiotus (Tardigrada: Parachela) en Santa Marta, Colombia

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Authors

Caicedo, Martín

Arquez, Moisés

Castro, Lyda R.

Quiroga, Sigmer

Publisher

Universidad del Magdalena

Description

Because of the great number of species and troubles with their morphological identification, many current taxonomic studies in tardigrades are based on the use of genetic and molecular techniques. In Colombia, studies focused in this discipline are needed to be able to complement the morphological information; consequently, seven COI gene sequences were analyzed in the genus of tardigrade Paramacrobiotus at the lower basin of the Manzanares River, in Santa Marta, and were compared with the sequences of the same genus present in the GenBank database through an analysis of specific divergence and neighbor-joining (NJ). The sequences obtained in the study showed a clear differentiation of the GenBank sequences, while at the same time showed a low intraspecific distance, obtaining a DNA barcoding for a single species. The differences obtained in comparison with the morphological analyses reflect the effectiveness of molecular techniques such as barcoding, emphasizing the importance of integration of molecular techniques to taxonomic studies on tardigrades.
Debido a la gran cantidad de especies y a las dificultades en su identificación morfológica, muchos estudios taxonómicos actuales de tardígrados se basan en el uso de técnicas genéticas y moleculares. En Colombia son necesarios estudios enfocados en esta disciplina que permitan complementar la información morfológica; por consiguiente se analizaron siete secuencias del gen COI en el género de tardígrado Paramacrobiotus de la cuenca baja del río Manzanares, en Santa Marta, y se compararon con las secuencias del mismo género presentes en la base de datos de GenBank a través de un análisis de divergencia específica y análisis de vecino más cercano (NJ). Las secuencias obtenidas en el estudio mostraron una clara diferenciación de las secuencias de GenBank y una baja distancia intraespecífica, obteniéndose el código de barras genético correspondiente a una sola especie. Las diferencias de los resultados con el análisis morfológico reflejan la eficacia de técnicas moleculares como los códigos de barras y evidencian la importancia de la integración de técnicas moleculares a los estudios taxonómicos de los tardígrados.

Keywords

richtersi; umbral de divergencia; citocromo oxidasa I (COI); taxonomía integrado, grupo richtersi, umbral de divergencia, citocromo oxidasa I (COI), taxonomía integradora, ichtersi group; divergence threshold; cytochrome oxidase I (COI); integrative taxonomy, richtersi group, divergence threshold, cytochrome oxidase I (COI), integrative taxonomy