Molecular characterization of 135 introduction of Capsicum from the bank of germplasm of the national university of Colombia, campus Palmira

Pardey Rodríguez, Catherine; García Dávila, Mario A.

Molecular characterization of 135 introduction of Capsicum from the bank of germplasm of the national university of Colombia, campus Palmira Caracterización molecular de 135 introducciones de Capsicum procedentes del banco de germoplasma de la Universidad Nacional de Colombia, sede Palmira

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Authors

Pardey Rodríguez, Catherine

García Dávila, Mario A.

Publisher

Universidad del Magdalena

Description

Molecular characterization of 135 introductions of Capsicum germplasm collection from National University of Colombia campus Palmira was carried out using 32 microsatellite primers for identifying a genetic variation among individuals of the five species studied: Capsicum annuum, C. frutescens, C. chinense, C. baccatum, and C. pubescens. The results showed that introductions are more in homozygous than in heterozygous state based on the rates of Fis and Fit, the greater variability among species was found in the omplex annuum, chinense, frutescens due to the number of polymorphic primers 21 of 32. The primers that showed the best polymorphism were those obtained from Lee et al. (2004), this primers showed high levels of diversity by having the highest number of alleles per locus and the higher number of alleles in heterozygous state; making them a powerful marker to measure genetic variability. The five species were genetically related to each other, however, the lower identity values occurred when any of the species was related to C. pubescens, or between C. baccatum and C. pubescens.
La caracterización molecular a 135 introducciones de Capsicum pertenecientes al banco de germoplasma de la Universidad Nacional de Colombia sede Palmira, utilizando 32 iniciadores para microsatélites permitió identificar la variabilidad genética  entre los individuos de las cinco especies estudiadas Capsicum annuum, C. frutescens, C. chinense, C. baccatum y C. pubescens. Los resultados mostraron que las introducciones se encuentran genéticamente más en estado homocigoto que en heterocigoto según los índices de Fis y Fit, la mayor variabilidad entre especies está en el complejo annuum-frutescens-chinense debido al mayor número de iniciadores polimórficos observados, 21 de 32. Los iniciadores que mostraron mejor polimorfismo fueron los de Lee et al. (2004), los cuales presentaron índices elevados de diversidad por poseer mayor cantidad de alelos por locus y a su vez por identificar mayor cantidad de alelos en estado heterocigoto. Por lo anterior, éstos serían útiles al momento de usarlos como medida de variabilidad genética. Las cinco especies se relacionaron genéticamente entre sí, la menor identidad genética  se sucede cuando cualquiera de las especies se relaciona con C. pubescens; y entre C. pubescens y C. baccatum.  

Keywords

Capsicum, microsatélites, variabilidad, índices de diversidad, Capsicum, microsatellites, variability, diversity index