Uso de código de barras de ADN para la diferenciación genética de fenotipos de la ardilla roja (Sciurus granatensis) asociada a un gradiente altitudinal en la Sierra Nevada de Santa Marta, Magdalena Colombia.

Abstract

El uso de código de barras de ADN es una técnica usada ampliamente para diferenciar la

variación intra e interespecífica en especies morfológicamente similares. La tribu Sciurini de

ardillas arbóreas es uno de los grupos de roedores más diversificados, sin embargo, existen

muchos vacíos filogenéticos que no permiten aclarar su organización. La ardilla roja Sciurus

granatensis muestra una gran variedad de colores en su pelaje desde ocre a un negro

predominante, lo que genera controversia en el momento de realizar la identificación taxonómica

de la especie. El objetivo del presente trabajo fue evaluar la identidad taxonómica en fenotipos

de Sciurus granatensis, determinando la divergencia intra e interespecífica con otras especies

del género, mediante el uso del gen citocromo oxidasa b. Se recolectaron 12 muestras de tejido

de oreja y pelo, el ADN extraído se amplificó mediante PCR convencional; las secuencias

obtenidas se compararon con tres secuencias de S. granatensis y 52 de otras especies del

género Sciurus descargadas del GenBank, las distancias intraespecífica e interespecífica se

calcularon mediante el uso del programa MEGA-X usando el promedio de distancia evolutiva,

posteriormente se realizaron análisis filogenéticos de máxima verosimilitud (ML) e inferencia

bayesiana (BI) de las secuencias. De este análisis se obtuvo que la distancia intraespecífica entre

las secuencias colectadas para el presente estudio muestra una baja divergencia (<1%), al

contrastarlas con las secuencias de S. granatensis del GenBank muestra un nivel de divergencia

mayor al 7%. La distancia interespecífica muestra a especies clasificadas como diferentes con

valores de distancia bajos (S. aurogaster y S. oculatus con 0.4%, S. arizonensis y S. nayaritensis

con 0.6%). Se concluye que hay una moderada divergencia entre las secuencias de la especie

S. granatensis a nivel regional, lo que sugiere realizar estudios más detallados que permitan dar

claridad a la incertidumbre taxonómica.