Uso de código de barras de ADN para la diferenciación genética de fenotipos de la ardilla roja (Sciurus granatensis) asociada a un gradiente altitudinal en la Sierra Nevada de Santa Marta, Magdalena Colombia.

dc.contributor.advisor Tamaris Turizo, Diana Patricia
dc.contributor.advisor Orozco Berdugo, Gilberto
dc.contributor.author Pardo González, Arsenio
dc.creator.degree Biólogo spa
dc.date.accessioned 2022-05-03T04:29:40Z
dc.date.available 2022-05-03T04:29:40Z
dc.date.issued 2022
dc.date.submitted 2021
dc.description.abstract El uso de código de barras de ADN es una técnica usada ampliamente para diferenciar la variación intra e interespecífica en especies morfológicamente similares. La tribu Sciurini de ardillas arbóreas es uno de los grupos de roedores más diversificados, sin embargo, existen muchos vacíos filogenéticos que no permiten aclarar su organización. La ardilla roja Sciurus granatensis muestra una gran variedad de colores en su pelaje desde ocre a un negro predominante, lo que genera controversia en el momento de realizar la identificación taxonómica de la especie. El objetivo del presente trabajo fue evaluar la identidad taxonómica en fenotipos de Sciurus granatensis, determinando la divergencia intra e interespecífica con otras especies del género, mediante el uso del gen citocromo oxidasa b. Se recolectaron 12 muestras de tejido de oreja y pelo, el ADN extraído se amplificó mediante PCR convencional; las secuencias obtenidas se compararon con tres secuencias de S. granatensis y 52 de otras especies del género Sciurus descargadas del GenBank, las distancias intraespecífica e interespecífica se calcularon mediante el uso del programa MEGA-X usando el promedio de distancia evolutiva, posteriormente se realizaron análisis filogenéticos de máxima verosimilitud (ML) e inferencia bayesiana (BI) de las secuencias. De este análisis se obtuvo que la distancia intraespecífica entre las secuencias colectadas para el presente estudio muestra una baja divergencia (<1%), al contrastarlas con las secuencias de S. granatensis del GenBank muestra un nivel de divergencia mayor al 7%. La distancia interespecífica muestra a especies clasificadas como diferentes con valores de distancia bajos (S. aurogaster y S. oculatus con 0.4%, S. arizonensis y S. nayaritensis con 0.6%). Se concluye que hay una moderada divergencia entre las secuencias de la especie S. granatensis a nivel regional, lo que sugiere realizar estudios más detallados que permitan dar claridad a la incertidumbre taxonómica. spa
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dc.format text spa
dc.identifier.uri http://repositorio.unimagdalena.edu.co/handle/123456789/7132
dc.language.iso es spa
dc.publisher Universidad del Magdalena spa
dc.publisher.department Facultad de Ciencias Básicas spa
dc.publisher.place Santa Marta spa
dc.publisher.program Biología spa
dc.rights Acceso Abierto
dc.rights info:eu-repo/semantics/openAccess
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dc.rights.cc Acceso Abierto spa
dc.rights.creativecommons https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
dc.rights.creativecommons atribucionnocomercialsinderivar spa
dc.subject.proposal Sciurus granatensis spa
dc.subject.proposal distancia genética spa
dc.subject.proposal código de barras de ADN spa
dc.subject.proposal citocromo oxidasa b spa
dc.title Uso de código de barras de ADN para la diferenciación genética de fenotipos de la ardilla roja (Sciurus granatensis) asociada a un gradiente altitudinal en la Sierra Nevada de Santa Marta, Magdalena Colombia. spa
dc.type bachelorThesis spa
dc.type.coar https://vocabularies.coar-repositories.org/resource_types/c_7a1f/
dc.type.driver info:eu-repo/semantics/bachelorThesis
dc.type.local Trabajo de Grado de Pregrado spa
dcs.type Trabajo de grado
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