Biología

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Browsing Biología by Subject "Amblyomma"
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    Detección molecular de Rickettsia spp. en garrapatas (Acari, Ixodidae) asociadas a la herpetofauna de la hacienda San Juan de Carare, departamento de Santander.
    (Universidad del Magdalena, Biología, 2021) Cárdenas Carreño, Juan José ; Castro García Lyda Raquel, Lyda Raquel ; Grupo de Investigación en Evolución, Sistemática y Ecología Molecular
    El conocimiento acerca de las garrapatas como vectores de enfermedades en Colombia, es limitado y las zonas del país donde se han realizado estudios de este tipo son escasas. Por consiguiente, el objetivo de este trabajo, consistió en identificar molecularmente las rickettsias presentes en garrapatas (Acari, Ixodidae) asociadas a la Herpetofauna de la Hacienda San Juan de Carare, departamento de Santander. Además, caracterizar la diversidad de rickettsias y compararla con la de los departamentos de Córdoba y Magdalena. Se generaron secuencias del género Rickettsia, y posteriormente se realizaron análisis filogenéticos de inferencia bayesiana (BI) y máxima verosimilitud (ML) con las secuencias generadas en el estudio y otras secuencias de Rickettsia descargadas de GenBank. De todas las muestras secuenciadas en el presente estudio, se identificó la presencia de una especie de Rickettsia, la cual corresponde a Candidatus Rickettsia colombianensi según su agrupamiento con los individuos disponibles en GenBank producto de las investigaciones desarrolladas en Córdoba y el Magdalena. Además, todas las garrapatas recolectadas se identificaron como Amblyomma dissimile, siendo la primera ocasión en la que se registra parasitando a la serpiente Leptodeira septentrionalis. No obstante, la prevalencia de Rickettsia exhibió valores muy altos, motivo que sustenta la importancia de seguir realizando estudios de este tipo en el país, que posibiliten tener mayor conocimiento respecto a la distribución y ecología de estos microorganismos, que sirva para consolidar políticas claras conforme a la salud pública en zonas rurales y urbanas, acerca de la temática en mención.
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    Diferenciación de dos especies de garrapatas (amblyomma dissimile y amblyomma rotundatum) mediante códigos de barras de ADN.
    (Universidad del Magdalena, Biología, 2019) Eguis Soler, Angie Mishell ; Castro García, Lyda Raquel ; Santodomingo Santodomingo, Adriana Milena ; Grupo de Investigación de Ecología, Sistemática, Evolución Molecular
    Para diferenciar especies morfológicamente similares, en los últimos años, se ha venido usando la técnica de “DNA barcoding” (Código de barras de ADN), además de las claves taxonómicas. Las características morfológicas de Amblyomma dissimile han entrado en discusión por su gran parecido con Amblyomma rotundatum, por ello se recomienda la identificación también con técnicas moleculares. El objetivo de este trabajo fue corroborar molecularmente la identificación de las muestras de garrapatas colectadas en anfibios y reptiles en marco del proyecto titulado Rickettsial infection in ticks (Acari: Ixodidae) from reptiles in the Colombian Caribbean (2018), desarrollado por el grupo GIESEMOL. Por lo tanto, se compararon algunas secuencias del género Amblyomma descargadas en GenBank y se evaluaron los valores de distancia genéticas intra e inter específicos con el programa MEGA 7.0, de este análisis se obtuvo que los genes 12S y COI eran los más adecuados para la identificación de los individuos del estudio. Posteriormente se realizó la verificación de ADN de las muestras del proyecto y a partir de las muestras comprobadas se amplificaron los dos genes seleccionados, se purificaron y secuenciaron. Con la herramienta BLAST de (www.ncbi.nlm.nih.gov) se compararon nuestras secuencias con las disponibles en la base de datos, se evaluaron las distancias inter e intra específicas de las secuencias obtenidas usando MEGA y posteriormente se realizaron análisis filogenéticos de inferencia bayesiana (BI) y máxima verosimilitud (ML) de las secuencias concatenadas de ambos genes de nuestras secuencias y otras secuencias de Amblyomma descargadas de GenBank. Las muestras de garrapatas que fueron recolectadas parasitando anfibios y reptiles de diferentes zonas del municipio de Santa Marta tienen un valor intraespecifico de 0.5% en COI y 0.3 en 12S. Se destacan los valores interespecíficos al diferir genéticamente en las especies de Amblyomma. Los porcentajes de identidad obtenidos son de 100% en Amblyomma dissimile y 94% para A. rotundatum, obteniendo la diversidad de nucleótidica en el gen 12S (0.0041) y el gen COI (0.0051) para las A. dissimile. Se concluye que todas las secuencias obtenidas en la investigación pertenecen a la especie A. dissimile según los análisis de código de barra genético con el gen COI y 12S. Palabras clave: Garrapatas, Amblyomma, Identificación, Diferenciación y Código de barras de ADN.